В 2004 году Отдел контроля РФФИ осуществлял поверки состояния дел использования средств целевого назначения, выделенных РФФИ грантодержателям в 2003 году.

1. Институт энергетических проблем химической физики РАН.
2. Государственный океанографический институт Росгидромета РФ.
3. ГУ Гидрометеорологический научно-исследовательский центр РФ.
4. Центр лазерной технологии и материаловедения при Институте общей физики РАН.
5. Институт археологии РАН.
6. Российский кардиологический научно-производственный комплекс МЗ РФ.
7. Институт российской истории РАН.
8. Библиотека по естественным наукам РАН.
9. Научно-исследовательский институт механики Московского государ-ственного университета им.М.В.Ломоносова.
10. Российский химико-технологический университет им.Д.И.Менделеева.
11. Институт фармакологии РАМН.
12. Биологический факультет МГУ им.М.В.Ломоносова.
13. Институт географии РАН.
14. Институт проблем механики РАН.
15. Институт государства и права РАН.
16. Институт оптико-нейронных технологий РАН.
17. Международный институт теории прогноза землетрясений и математи-ческой геофизики РАН.
18. Институт водных проблем РАН.
19. Научно-исследовательский центр электронных диагностических сис-тем ЭЛДИС РАН.
20. Московская государственная академия приборостроения и информати-ки.
21. Московский государственный университет инженерной экологии.
22. Химический факультет МГУ им.М.В.Ломоносова.
23. Московская медицинская академия им.И.М.Сеченова.
24. ГНИИ прикладной механики и электродинамики Московского авиаци-онного института.
25. Институт научной информации по общественным наукам РАН.
26. ГУ НИИ прикладной математики и механики МГТУ им. Н.Э.Баумана.
27. ГУ НИИ эпидемиологии и микробиологии им Н.Ф.Гамалеи РАМН.
28. Институт человека РАН.
29. Гос.научный центр РФ Институт медико-биологических проблем.
30. Московский физико-технический институт.( г.Долгопрудный)
31. Учебный научно-производственный комплекс Московского физико-технического института.(г. Долгопрудный)
32. Московский педагогический государственный университет.
33. ФГУ РНЦ Курчатовский институт.
34. Гос.учебно-производственое учреждение Факультет наук о материалах МГУ им.Ломоносова.
35. ГУ Научный Центр психического здоровья РАМН.
36. Экоцентр МГУ.
37. Институт проблем безопасного развития атомной энергетики РАН.
38. ФГУП Институт минералогии, геохимии и кристаллохимии редких элементов Министерства природных ресурсов.
39. Институт биологии внутренних вод им. И.Д.Папанина (п.Борок)
40. Институт геологии рудных месторождений, петрографии, минералогии и геохимии РАН.
41. Институт народно-хозяйственного прогнозирования РАН.
42. ГУ научно-исследовательский институт физико-химической медицины МЗ РФ.

Организации, в которых были выявлены нарушения в использовании средств целевого назначения.

1. Государственный океанографиче-ский институт Росгидромета РФ. Директор Комчатов В.Ф.
2. Государственное учреждение Гидрометеорологический научно- исследовательский центр РФ. Директор Вильфанд Р.М.
3. Научно-исследовательский институт механики МГУ им. М.В. Ломоно-сова. Директор Окунев Ю.М.
4. Институт фармакологии РАМН. Директор Середенин С.Б.
5. Биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова. Декан Гусев М.В.
6. Институт проблем механики РАН. Директор академик Климов Д.М.
7. Международный институт теории прогноза землетрясений и математической геофизики РАН. Директор Соловьев А.А.
8. Институт водных проблем РАН. Директор член-корреспондент РАН Данилов-Данильян В.И.
9. Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина. Директор Копылов А.И.
10. Институт геологии рудных месторождений, петрографии, минералогии и геохимии РАН. Директор Бортников Н.С.
11. Институт народно-хозяйственного прогнозирования РАН. Директор академик Ивантер В.В.

Основные нарушения, допущенные руководителями проектов и администра-цией:

1. Не соблюдались правила РФФИ оформления финансовых отчетов.
2. На средства грантов приобретались товары бытового назначения без соот-ветствующих обоснований их использования в научных исследованиях.
3. Не соблюдались правила оформления договорных документов со сторон-ними организациями и внештатными сотрудниками. Руководство организа-ций не требовало от руководителей проектов представления копий Уставов и лицензий от таких организаций как ООО, ЗАО и др. организаций с которыми заключались договора.
4. Не соблюдались требования законодательных органов оформления коман-дировочных документов сотрудников, членов творческих коллективов, направлявшихся в научные поездки.